قبل مجيئه إلى دولة الإمارات العربية المتحدة، عمل د/ أمير علي أستاذاً مساعداً في معهد أمراض الكلى ومركز الأبحاث الشهير في ولاية غوجارات، وهو المركز الرائد في الهند في زراعة الكلى وعلاج حصوات الكلى. وقد عمل أيضًا كاستشاري أمراض المسالك البولية في مستشفى أستر برايم، حيدر أباد ومستشفى ماكسكير، وارانجال.
عمل د/ أمير استشارياً لأمراض المسالك البولية منذ عام 2018 حتى عام 2021 في مستشفى أن أم سي التخصصي في أبوظبي. خلال هذا الوقت، كانت مساهماته في قسم المسالك البولية ناجحة وحافلة. لقد كان من ضمن أوائل الأطباء الذين بدأوا جراحات استئصال حصوات الكلى عن طريق الجلد والجراحات خلف الصفاق عن طريق المنظار. كما أنه قد أجرى أول عملية لاستئصال الكلي عن طريق المنظار الجراحي عبر فتح الغشاء البريتوني في دولة الإمارات العربية المتحدة.
انتقل د/ أمير بعد ذلك إلى المملكة المتحدة وأصقل مهاراته ليصبح جراحًا بمساعدة الروبوت. وقد تلقى تدريبًا رسميًا على أحدث نظام جراحي عن طريق الروبوت وهو نظام دافنشي وشارك في أكثر من 250 عملية استئصال للبروستاتا عن طريق الروبوت واستئصال الكلية الجزئي واستئصال المثانة. لقد عمل في هيئة الخدمات الصحية الوطنية بجانب بعض أفضل أطباء المسالك البولية في المملكة المتحدة.